transkrypcja.pdf

(3038 KB) Pobierz
31152418 UNPDF
Zgodnie z ogólnie przyjętą konwencją, geny na schematach przedstawia
się od lewej do prawej , w kierunku transkrypcji . Nić DNA z taką samą
sekwencją nukleotydów jak RNA, tzw. nić kodującą , pokazuje się u góry ,
5’ końcem po lewej i 3’ końcem po prawej ; dla wygody pokazuje si ę cz ę sto
tylko ją. Nić DNA komplementarną do mRNA nazywa si ę nicią matrycową ,
bo służy jako matryca w procesie transkrypcji. Termin odcinek
(sekwencja) po stronie 5’ lub 3’- odnosi si ę do sekwencji nukleotydowych,
odpowiednio, poprzedzających i następujących po regionie kodującym.
31152418.014.png 31152418.015.png 31152418.016.png
geny mają różną orientację
31152418.017.png 31152418.001.png 31152418.002.png
holoenzym prokariotycznej pol RNA, RNAP, 465 kDa :
rdzeń zdolny do elongacji transkrypcji, α 2 ββ
α 40 kD gen rpoA sk ł adanie enzymu
β 155 kDA gen rpoB wiązanie nukleotydu
β ’ 160 kDA, gen rpoC wiązanie matrycy
podjednostka σ niezb ę dna do inicjacji transkrypcji (32-90
kDA, σ 70 – gen rpoD), rozpoznaje i specyficznie wiąże
elementy promotora : elem. -10 i -35
31152418.003.png 31152418.004.png 31152418.005.png 31152418.006.png
C-terminalna domena (CTD)
podjedn. α oddzia ł uje
zarówno z wy ż ej po ł o ż onymi
specyficznymi sekwencjami
regulatorowymi (UP) w DNA
jak i bia ł kowymi aktywatorami
31152418.007.png 31152418.008.png 31152418.009.png
rodzaje podjednostek σ
Gene
Use
-35
Separation
-10
σ 70
rpoD
General
TTGACA
16-19 bp
TATAAT
σ 32
rpoH
Heat shock
CCCTTGAA
13-15 bp
CCCGATNT
σ 28
fliA
Flagella
CTAAA
15 bp
GCCGATAA
σ 54
rpoN
Nitrogen starvation
CTGGNA
6 bp
TTGCA
http://www.faculty.biol.ttu.edu/densmore/MB06pdfs/mb.06.lect26.%20chap%201 6.pdf
31152418.010.png 31152418.011.png 31152418.012.png 31152418.013.png
Zgłoś jeśli naruszono regulamin